复合肥比较单质肥有明显优越性。但在选用时要注意走出如下误区。
1、不分作物种类使用。不同农作物对复合肥中的养分形态和比例需求不一样。但在生产中不分作物种类而盲目使用的情况比较多见。如低磷含量复合肥用于早稻、油菜等作物则明显不能满足这些作物对磷素的需要，低钾含量的复合肥则不能满足玉米、晚稻、红薯、烤烟、甘蔗等需钾量较大的农作物需要。特别是含氯比较多的复合肥在烤烟、茶叶、西瓜等忌氯作物上使用，引起烤烟燃烧性变差、西瓜变咸不甜、茶叶新叶死亡，严重降低农产品品质。因此要根据不同农作物需肥特点来选择适当的复合肥品种。一般说来，禾谷类作物施肥要以提高产量为主，主要应根据土壤养分丰缺状况来确定复合肥中养分形态和配比；而经济作物对氮磷钾需求量钾＞氮＞磷，经济作物增施钾肥不仅可以提高产量，更重要的是对改善品质有重要作用。与大多数经济作物一样，块根类作物（如红薯）、根茎类作物（莲藕、玉竹等）、玉米、晚稻等宜选用含钾量比较高的复合肥；相对而言，早稻、花生、芝麻、油菜、辣椒等作物要注意选用含磷量较高的复合肥；叶类蔬菜宜选用含氮量较高的复合肥。西瓜、草莓、葡萄、柑桔、烤烟、茶叶等忌氯作物应选用含氯量低的硫基复合肥。鉴于复合肥养分比例固定，在使用时要配合使用单质肥。以复合肥为主，单质肥用以调节和补充。提倡使用专用复合肥，如水稻专用肥，柑桔专用肥，西瓜专用肥等。
2、不分土壤类型使用。如含硝态氮复合肥在水田中使用，因淋溶性和反硝化脱氮作用而损失严重；含枸溶性磷肥（如钙镁磷肥）复合肥在石灰性土壤（偏碱性）使用则肥效差。有鉴于此，含硝态氮复合肥应在旱地上使用，而不宜在水田里使用；含氯离子和铵离子的复合肥不宜在盐碱地上使用；含硫酸根离子复合肥最好不要在水田上使用，含钙镁磷肥复合肥宜在酸性土壤和中性土壤上使用。
3、施用时期和部位不当。如在农作物生长发育后期使用复合肥引起贪青晚熟，肥料接触种子引起肥害等；复合肥分解比较缓慢，不易流失和挥发，肥效持续时间较长，应主要作基肥使用。在农作物生长后期不宜使用复合肥，如需施肥可及时补充速效肥。复合肥在用种量较少时，可作种肥施用，但要将种子与肥料隔开；复合肥在用肥量较大时可作基肥全耕层深施，在稻田可作面肥施用。