对植物生长的影响
腐植酸能促进植物根系的生长。增强根系活力，并促进分蘖数量和次生根的增加、延长。
提高种子的发芽率。施用腐植酸，可加速种籽发芽，提高出苗率，在早春、低温下尤为显著(一般可提早1-3天发芽，出苗率提高10%-30%)。
提高作物的抗旱性。腐植酸的施用，能使植物叶片气孔张开度减少，叶片蒸腾量降低，耗水量减少，植株体内的水分状况得到改善，使叶片含水率提高。从而为分穗和成籽奠定了基础，腐植酸的施用还能够提高叶绿素的含量和光合作用的正常进行，对于物质的积累和千粒重的提高是非常重要的。
提高作物的抗寒性。施用腐植酸对南方的早春育秧和北方小麦的抗寒都有明显效果。中国南方各地在早稻育秧，经常遇到低温多雨天气，往往发生死苗，烂苗现象，施用腐植酸后，地温得到提高，秧苗素质普遍得到改善。西南农业大学在试验时发现，中国北方大部分地区的冬小麦，由于经常出现倒春寒，麦苗普遍受到冬害，施用腐植酸，有效地提高了小麦的抗寒能力，不同程度地减轻了冻害。
有效提高作物中叶绿素的含量。腐植酸对提高植物叶绿素含量的效应非常明显，不管用什么方式处理作物都能明显提高作物叶绿素的含量，如小麦施用腐植酸肥料，其叶片衰老指数比对照组好一倍。
刺激作物的生理代谢及提高酶活性。腐植酸进入植物体内后，对植物起到刺激作用，主要表现在呼吸强度的增加、光合作用的增加、各种酶的活动增强，从而使果实提前着色成熟，取得高产、高值(经济作物的应市性)。
对养分的缓释增效作用
对氮肥的增效作用。腐植酸是天然的脲酶抑制剂，能减缓尿素的酶解，减少氨挥发； 腐植酸中的羧基、酚羟基等基团对铵态氮有络合作用，吸附缓释作用，可以减少氮流失，提高氮肥利用率。
对磷肥的增效作用。腐植酸能抑制土壤对磷的固定，提高磷在土壤中的移动距离，同时，延缓速效磷向迟效、无效磷转化的速度，并能活化土壤固定磷，提高土壤有效磷含量，提高磷肥利用率和肥效。
对钾肥的增效作用。腐植酸有较强的阳离子交换量和吸附能力，其官能团可以吸收存储钾离子，使钾肥缓慢分解，增加钾的释放量，提高速效钾的含量；活化土壤钾素，提高钾肥的利用率。
对微量元素的增效作用。腐植酸与难溶性微量元素可以发生螯合反应，生成溶解性好可被作物吸收的腐植酸微量元素螯合物，从而有利于根系和叶面吸收微量元素。
土壤环境保护功能
改良土壤环境条件。使用腐植酸，可改变土壤中含盐过高、碱性过强、土粒高度分散、土壤结构性差的理化性状，促进土壤团聚体的形成，使其成良好状态，从而为植物根系生长发育创造良好的条件。
腐植酸能促进土壤团粒的形成。腐植酸中的羟基、羧基功能团易与土壤中的钙离子发生凝固反应，再通过植物根系的生理作用就形成了土壤的团粒结构，从而使土壤的空隙度相对增大，通透性更好，有利于农作物吸收养分和正常生长。
利用腐植酸的酸性与盐碱土中的碱性发生中和反应的原理可调节土壤的pH值，从而达到治理盐碱的效果。腐植酸颜色深，有利于对太阳能的吸收，当腐植酸受到微生物的作用分解时再放出热量，土壤中足够的腐植酸能使地温提高而充分起到抗春寒的作用。
防治土壤重金属污染。腐植酸参与土壤中离子交换反应，把土壤中的重金属离子吸附固定，防止它们进入生物循环；能稳定土壤结构，为土壤微生物活动提供基质和能源，从而间接地影响土壤中重金属离子的活动能力。
腐植酸与土壤中的重金属离子络合反应，起到钝化重金属离子，防止重金属离子大量进入植物体系的作用。
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