1、装盘：常规基质在装盘前，应先加入一定无污染的水拌匀，便其湿润(即：湿润后的基质以捏之成团，松开即散为宜)。
2、播种：播种时，用压穴板压穴，将种子播于育苗穴中间，  中间每穴播1粒，每盘延边播2 3行2粒，注意应使基质与种子充分接触。播种后第二天必须严格进行检查，对“于孔”作及时处理(用小木棍轻插出现干孔的基质)。
3、施肥：漂浮育苗施肥时间宜在出苗后进行，第一次施肥是在烟苗出齐时进行，施肥时必须将营养液肥先溶解，再分多点放入池中，并与池水均匀混合。第二次施肥时间宜在第一次施肥后20天左右进行，施肥量与第一次相同。
4、温湿度管理：(1)温度：烤烟生长的最佳温度是25～28℃，超过32℃要揭膜降温，原则是：早晚保温，中午降温。(2)湿度：若气候长期处于阴天，气温较低，湿度较大，在上午8时一9时开棚，降低湿度，开棚时间约1小时，然后再关上大棚。若是晴天，气温较高，须在上午9时开棚，下午17时左右关棚。
5、定苗：当烟苗长到3片真叶时定苗。方法是把每孔多余的烟苗间出，补在没苗的孔内，保证一孔一苗。
6、剪叶炼苗：(1)剪叶：必须使用剪叶器剪叶，剪叶前应用800倍液的毒消喷施叶面，药液干后方可剪叶。正确的剪叶、炼苗方法是“前促、中稳、后控”，第一次剪叶一般苗高8 cm左右，要“少剪、平剪”，以后每隔4—5天剪一次，一般剪4—5次。(2)炼苗：一般第二次剪叶后可逐渐揭去棚膜进行炼苗。移栽前10天左右，将苗池的水加满，稀释肥料浓度，让育苗盘上浮露打进行炼苗。并揭开薄膜，只盖防虫网，让阳光充分照射，一直坚持到移栽。
7、注意病虫害的防治和生理性病害：(1)盐害：通过加水稀释营养液和加强通风揭膜可消除盐害。(2)冷害：避免冷害的方法是低温时盖严棚保温。(3)热害：避免热害的方法是严格按操作规程进行揭膜通风。
8、其它管理要求按《砚山县2009年烤烟标准化生产技术实施方案》进行。