由于日光温室的特殊环境，为蔬菜病虫害的发生和蔓延提供了有利条件。蔬菜病虫害的防治，必须坚持“预防为主，综合防治”的植保方针。本着安全、有效、经济、简便的原则，有机地协调使用农业、生物、化学和物理的配套措施，严格控制病虫害的发生，将危害降到最低，达到高产、优质、低成本和无农药污染的目的。
　　一、番茄主要病虫害防治
　　（一）番茄叶霉病和灰霉病
　　1、生态防治：上午保持较高温度；下午适当延长放风时间和放风量，减少或避免叶面结露。
　　2、药剂防治：用6.5%万霉灵粉尘，每亩每次用1kg，7天喷一次，连喷3－4次。用47%加瑞农可湿性粉剂800倍液或50%扑海因可湿性粉剂1500倍液或65%甲霉灵可湿性粉剂800―1500倍液，或50%农利灵可湿性粉剂1000倍液，或2%武夷菌素水剂100倍液，视病情连续防2－3次喷洒。
　　（二）早疫病
　　1、用5%百菌清粉尘1kg/666.7m2喷粉，7天喷一次。
　　2、用45%百菌清烟雾剂，每亩250--300g，分放5－6处，傍晚点燃闭棚过夜，7天熏一次，连熏3－4次。
　　3、用72%克露可湿性粉剂600--800倍液，或72.2%普力克水剂800倍液喷雾或52.5%抑快净水分散粒剂或70%甲基托布津可湿性粉剂1000倍液喷施，连续喷施3天。
　　二、黄瓜主要病害防治
　　（一）霜霉病
　　1、用5%百菌清粉尘，每666.7m2每次用1公斤。
　　2、用45%百菌清烟雾剂，每666.7m2250--300g，分放4－5处，傍晚点燃闭棚过夜，7天熏一次，连熏3次。
　　3、用72.2%普力克水剂800倍液，或72%克露可湿性粉剂800倍液、68.75%易保可湿性粉剂500倍液或69%安克―锰锌可湿性粉剂500―1000倍液喷雾。
　　（二）细菌性角斑病
　　50%琥胶肥酸铜可湿性粉剂400―500倍液，或77%可杀得可湿性粉剂500倍液，或72%农用硫酸链霉素可溶性粉剂4000倍液，或60%琥。乙磷铝可湿性粉剂500倍液喷雾，3天―5天喷一次，连喷2―3次。
　　三、辣椒病害
　　（一）疫病
　　1、发病初期用45%百菌清烟雾剂密闭棚室熏蒸，每亩药量250―300g，7天1次，视病情可连续熏蒸3―4次。
　　2、用5%百菌清粉尘剂喷粉，每亩1kg药粉，7天1次，连续2―3次。
　　3、发病初期，用64%杀毒矾可湿性粉剂500倍液，或58%雷多米尔500倍液、70%乙磷铝锰锌可湿性粉剂500倍液喷雾。
　　中后期用50%甲霜铜可湿性粉剂800倍液、72.2%普力克水剂600―800倍液、64%杀毒矾可湿性粉剂500倍液，或58%雷多米尔？锰锌可湿性粉剂500倍液。
　　（二）白粉病
　　用40%福星乳油4000倍液，或40%多硫悬浮剂600倍液，或50%翠贝水分散粒剂3000倍液，或15%粉锈宁可湿性粉剂1500倍液喷雾，7天―10天喷一次，共喷3―4次。
　　用70%甲基托布津可湿性粉剂800―1000倍液，或50%多菌灵可湿性粉剂800―1000倍液，或10%双效灵水剂300倍液或30%恶霉灵水剂1000倍液灌根，每株灌药液0.25―0.5kg，10天左右再灌一次，连灌2―3次。
　　四、主要虫害
　　（一）温室白粉虱
　　1、用22%敌敌畏烟雾剂500g/666.7m2，傍晚闭棚前点燃。密闭一昼夜。
　　2、1.8%阿维菌素乳油3000倍液，或用10%吡虫琳可湿性粉剂1500倍液喷雾或25%扑虱灵乳油1000倍液喷雾。
　　（二）蚜虫
　　1、用22%敌敌喂烟剂，每666.7m2用药500g。
　　2、用10%吡虫啉可湿性粉剂1500倍液。或2.5%三氟氯氰菊酯乳油4000倍液，或3%啶虫脒乳油1000―1250倍液喷雾。
　　（三）美洲斑潜蝇
　　用1.8%阿维菌素乳油3000倍液，也可用40%绿菜宝乳油1000倍液或10%灭蝇胺悬浮剂1500倍液喷施。