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芝麻收获脱粒晒干去杂后，应妥善贮藏。为保证种子安全贮藏，种子含水量必须小于7％，种子入库前，一是应清洁仓库环境，消灭仓库虫害、寄生菌类及鼠害；二是种子应风干去杂，去掉易吸潮杂物；三是贮藏地点必须通风干燥，下面需有隔潮物垫底。 贮藏方法可分包装、囤装和罐装3种。包装采用化纤品或塑料薄膜双层粘合的特制防潮，它既可以控制温、湿度，又便于运输；囤装要在囤的上下或周围内侧加塑料薄膜密封层，囤必须设置内径30cm左右竹编散热筒，并用塑料薄膜镶好外径；罐装多为群众留种使用，可以防湿、防鼠、不生虫、不霉变，贮藏效果较好。另外，科研单位因所用育种材料因其量少，也有用无水氯化钙或硅胶作干燥剂在玻璃干燥器内保存的。
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沼肥包括沼渣、沼液，是一种氮、磷、钾齐全，速缓兼备的优质有机肥料。产沼气过程中，由于高温发酵和极端的厌氧环境，其中大量的寄生虫和病源微生物被杀死或抑制，因此，沼肥是一种安全、优质、高效的无公害肥料。但是，沼肥中含有较多易挥发的氨态氮，如果施用方法不当，容易损失肥效。因此，广大农民朋友在使用沼肥时，应该注意几项问题。 1、沼肥应随出随施，不宜久存。一般从沼气池中取出后，就应直接施到田里，实在忙不过来时，最多也只能堆放1－2天。时间拖得越久，氨态氮损失越多。一时不用的沼肥，应及时存放在有盖的桶中或粪池内，还可以加入0.1％至0.2％的过磷酸钙，使易挥发的氨态氮变成不易挥发的磷酸一铵和磷酸二铵，以保持肥效。 2、沼渣宜作为基肥深施。施用于水田时，最好是在耕田时使用，使泥、肥混合，每亩施用量大约2000公斤；施用于旱地时，最好是集中施用，如穴施、沟施，然后覆盖10厘米厚度的土层，以减少养分挥发。 3、沼液宜作为追肥施用。施用时，应根据沼液的质量和作物生长情况，适当掺水稀释，以免伤害作物的幼根或嫩叶。沼液可按一定比例结合灌溉施用，也可进行喷施。沼液可与尿素等化肥配合使用，沼液能帮助化肥在土壤中溶解，吸附和刺激作物吸收养分，提高化肥利用率。一般每50公斤沼液中可加入0．5至1公斤尿素。 4、沼液还可作为叶面肥喷施，既可补充养分，又可防治病虫害，适用于多种作物。叶面喷施一定要掌握好各种作物不同生长发育期施用的适宜浓度，以防烧坏叶面。一般作物在幼苗期用1份新鲜沼液加水1－1.5倍，瓜菜类作物幼苗期要加水1.5－2倍，作物生长的中后期以及果树的施用浓度，一般用1份新鲜沼液加水0.5－1倍较为合适。 5、将沼肥按1：1的比例与稻草、飞机草或其它杂肥（要切成10厘米左右）等混合堆沤30－40天，可制成堆肥。
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